Yuko Miyamura

ในเมืองฮาโกะดาเตะ, ฮอกไกโด จอมโจรคิดได้ส่งสารเพื่อประกาศการปล้นอีกครั้ง โดยเป้าหมายคือดาบญี่ปุ่นที่เกี่ยวข้องกับนักรบในอดีต โทชิโซ ฮิจิกาตะ รองหัวหน้ากลุ่มชินเซ็นกุมิ ขณะเดียวกัน โคนัน และเพื่อน ๆ รวมทั้ง ฮัตโตริ เฮย์จิ ยอดนักสืบฝั่งตะวันตก ก็อยู่ที่เมืองฮาโกะดาเตะ เพื่อเข้าชมการแข่งขันเคนโด้ ต้องเผชิญหน้ากับสถานการณ์การปล้นเหนือเมฆครั้งใหม่ เหตุใดจอมโจรคิดถึงได้สนใจดาบเก่าแก่เล่มนี้กันนะ ปริศนามากมายถาโถมเข้ามาอีกครั้ง ความลับของดาบเล่มนี้คืออะไรกันแน่ ร่วมไขคดีที่มีฉากหลังเป็นทิวทัศน์ระดับร้อยลานดอลลาร์ไปพร้อมกัน!

ผ่านไป 14 ปี ชินจิตื่นขึ้นมาบนเรือรบเอเอเอ วุนเดอร์ขององค์กรต่อต้านเนิร์ฟที่ก่อตั้งโดยอดีตสมาชิกของเนิร์ฟ ชินจิได้ยินเสียงของเรย์ดังมาจากอีวามาร์ค 09 ที่ถูกส่งมาช่วยเขา เขาจึงหนีออกจากวุนเดอร์และมุ่งหน้าไปยังเนิร์ฟ คาโวรุ นางิสะพาชินจิไปดูดินแดนที่กลายสภาพ เขาจึงได้รู้ว่าการช่วยชีวิตเรย์ส่งผลให้เกิดเนียร์เธิร์ดอิมแพกต์ที่ทำลายล้างโลกอย่างราบคาบ

มาริ อิลลัสเทรียส-มากินามินำหุ่นรบเฉพาะกาลหมายเลข 05 ออกต่อสู้พิชิตเทวทูตตนที่สาม อาสุกะ แลงลีย์-ชิกินามิและอีวา-02 เอาชนะเทวทูตตนที่เจ็ดได้สำเร็จ เทวทูตตนที่แปดปรากฏตัวและถล่มสำนักงานใหญ่เนิร์ฟ อีวา-03 ถูกเทวทูตตนที่เก้ายึดไปขณะทำการทดสอบและชินจิก็เข้าหยุดยั้ง แต่ก็ได้รู้ว่าอาสุกะอยู่บนหุ่นรบตัวนั้น เก็นโดเปลี่ยนการควบคุมอีวา-01 เป็นระบบดัมมี่และเริ่มการต่อสู้กับอีวา-03